天元公学音乐部以开发中小学音乐、舞蹈天赋，培养音乐、舞蹈人才为己任；全面提高高中音乐、舞蹈特长班学生艺考专业课程和文化课、综合素质测评成绩；为学生开通迈向国内外著名音乐、舞蹈院校的专业学习通道；为知名师范类院校和综合类大学输送优质生源。为保证音乐部办学的专业性和权威性，学校设立了音乐专家委员会，由中央音乐学院原院长王次炤担任主任，中国歌剧舞剧院艺术总监、中国音乐剧研究会副会长李小祥等多位音乐、舞蹈名家担任委员与顾问；音乐部教学团队专业教师均毕业于各大专业音乐院校，研究生学历达到100%。文化课与高中部实习教学资源共享，提高教学的针对性和有效性。学校建有标准的双管制交响乐团——杭州爱乐乐团青少年分团·天元乐团，为学生的音乐专业特长培养提供大师指导和实训平台。